克隆戰爭的全面爆發讓帕爾帕丁議長在共和國幾乎擁有了至高無上的權力，而在他的“領導”下，共和國也越來越深的陷入戰爭的泥潭……一批又一批裝備精良的克隆人戰士奔赴各個星球，與分裂組織的機器人部隊展開激戰。克隆戰士的成長方式如同種植，而生命的價值也恰似草芥，整個宇宙，已經在戰火中變得麻木。盡管大師尤達對戰爭還保持著一絲清醒，但更多絕地武士都在忠章男懈髯员Ｐl共和國的職責，他們施展功力，奮勇戰斗，將“以暴制暴”發揮到了極致。 　　悄悄經歷了新婚之喜的阿納金·天行者與一直關心并擔心他的師傅歐比旺·克諾比也投身于這場戰爭之中。然而他們的共事并不愉快，歐比旺希望阿納金控制個人魯莽和憤怒的情緒，可阿納金卻堅持認為歐比旺嫉妒他的能力。的確，在戰場上，阿納金機智勇敢，他的表現著實讓歐比旺頗為失色。潛藏的沖突最終讓師徒二人奔向不同的戰場，歐比旺被派遣去攻打分裂組織的根據地，而阿納金則在帕爾帕丁議長的慫恿下力爭到了在外太空率領飛船作戰的任務，這恰恰是歐比旺最不喜歡的戰斗類型。 　　空戰中，阿納金感受到了強大的原力，于是他不顧師傅的阻止，追隨一艘飛船并找到了那股原力的源頭——一位使用兩把紅色光劍的高傲的女劍客。在雨中，阿納金與女劍客展開激烈的搏斗。喪母之痛、斷臂之恨以及囂張的女劍客，這些都讓阿納金陷于憤怒的層層包圍之中。紅藍交錯，光劍交鋒。最終，阿納金戰勝了這個強大的對手并把她扔下懸崖，但憤怒也使他向原力黑暗面更進了一步，再次感受到黑暗臨近的尤達大師憂心忡忡卻還是無可奈何。 　　在克隆人部隊的強大攻勢下，機器人軍隊節節敗退。可就在戰局發生轉機之時，分裂組織中出現了一位強大的機器人將軍格里佛斯，他攻無不克，戰無不勝，成為絕地大師的最大敵手。他的加入使戰爭的主動權重新回到了分裂組織手中，帕爾帕丁議長的陰忠哺�進了一步……