口袋妖怪救援隊的巴基爾結束山地救援任務啟程返回基地，途中緊急著陸到某個山頭，在那裡遇到了少女安娜和老人奧斯卡，聽說了前所未聞的被口袋妖怪所救的體驗經歷。
突然謎之男子丹克表示那隻口袋妖怪肯定是超夢，前幾天自己也被超夢所救，但是超夢也在那個時候受到重傷。於是巴基爾決定前往救助超夢，被人類製造出來的超夢並不信任人類，於是巴基爾通過伊布，安娜通過森林裡的口袋妖怪們來協助搜索……
然而這時出現在那裡的，是追逐在口袋妖怪們身後的奇怪頭和狂笑的丹克的身影……丹克的目的究竟是！ ？