只有女性能使用的世界最強兵器「IS」在日本公布開發以后，世界也處于了女尊男卑的狀態。培育IS操縱者的學校「IS學園」是，集合來自世界各地的代表候補生少女的女子學校。然而，主角「織斑一夏」雖然身為男生卻不知什么原因能夠起動IS，為此他被強制送進「IS學園」上學。女子學院里唯一的男生，穿插于以青梅竹馬的劍道少女箒為首，不同國籍各色各樣的少女們當中，疾風怒號的戰斗與戀愛生活。突然襲擊而來的敵人，IS所隱藏的秘密，還有圍繞于一夏身邊的少女們的前路將會！？