21世紀初期，地球不再有侵略和戰爭，人類期盼已久的和平終於到來了。地球防衛軍組織也因此完成了曆史使命，TPC(地球和平聯合)組織成立，人類迎來了新的的時代。但是，在實現世界性非武裝化的2007年，地球又突然出現了怪獸。如超古代文明人幽憐所預言：二大怪獸“哥爾讚”及“美爾巴”出現了。在怪獸攻擊的目標--金字塔內，發現了3座巨大的石像。2座巨像被怪獸摧毀了！在這緊要關頭，有著超古代人遺傳子、屬於地球和平聯合特搜查隊(TPC)。“GUTS”分隊的大古隊員、全身被光所包圍，並融身於剩下的1座巨像內--迪迦·奧特曼在現代複活了！迪迦的故事隨之展開。