阿爾法戰士第二季一名即將出庭的證人在聯邦法院的密室里離奇遇害，第八區的特工奉命前來調查。第八區是由美國國家安全局出資建立的一個秘密行動組，領頭人是Leigh Rosen博士。他們的任務只有一個－－找到那些被稱作 \"阿爾法人\" 的家伙，評估他們的危險程度。\"阿爾法人\" 是大腦結構發生變異的人類，他們因此獲得了常人所沒有的超能力。協助Rosen博士進行調查的就是四名這樣的 \"阿爾法人\"－－Gary Bell，具有高功能自閉癥，但是大腦處理信息的能力卻能匹敵當今世界上最強悍的超級計算機；Bill Harken，一名前FBI特工，能在打斗中放大自己的肌肉靈敏度，忘掉恐懼，并在一段很短的時間內獲得非常驚人的臂力；Nina Theroux，美艷無雙的金發女郎，能夠輕松改變他人的大腦意識，按她的命令行事；Rachel Myers，非常正統的猶太女子，可只要她低語一聲，就能震碎周圍所有的玻璃。 不幸的是，事物總有兩面－－要使用這些超能力就必須付出代價。對Gary來說，自閉癥讓他的興趣、愛好、行為宛如孩；對Harken來說，永無止境的怒火讓他失去了工作，也失去了家人；對Rachel來說，生活沒有一丁點樂趣，她不能發出一點聲音，平時也必須帶上鎖住喉嚨的電子裝置；而對Nina來說，她永遠不知道自己身邊的人對她有何真實感受，她甚至感覺不到真實的自我。不過，在Rosen的幫助和調教下，他們最終走到了一起，為正義而戰。Rosen不僅是他們的導師，更是他們的朋友。他每天都教給他們控制自己能力的方法，同時也教給他們做人的道理。 Rosen和他的小組很快便發現，一名叫Christian Hicks的 \"阿爾法人\" 該對法院謿�案負責。此人曾是海軍陸戰隊的神槍手，擁有超人的平衡性和瞄準度－－他甚至可以通過槍管直接引導子彈出膛的角度和速度。雖然Christian Hicks伏法了，但是更為厲害的幕后操縱者卻浮出了水面……此人擁有一項不可思議的新技術，可以隨意模仿第八區某個成員的超能力。