今年第13部《幻影的霸者 佐羅亞庫》同時也是《口袋妖怪 鉆石&珍珠》系列的第4彈，在最新作中，從未見過的新口袋妖怪“佐羅亞”與能自在操控幻影的“佐羅亞庫”將首度登場 ，幻之口袋妖怪“雪拉比”和傳說的口袋妖怪“雷公”、“炎帝”、“水君”也將活躍於大螢幕上。

　　出現的炎帝、水君、雷公分別對城市的襲擊，雪拉比被一群鐵面忍者追逐，反派人物登場，ゾロア的出現。另外，ゾロアーク亦可分別變成炎帝、水君、雷公以及小智的樣子。

　　旁白臺詞說到：包圍世界的「時間波紋」的能量，那時雪拉比看到的未來是…！？

　　王冠市是個水與綠茵、古街道與近代建筑完美調合的城市。為了觀看正在這里舉辦的『神奇寶貝足籃世界杯』，小智一行人向王冠市前進。 在旅途中，小智們與正在尋找同伴的神奇寶貝『索羅亞』相遇，并一起結伴同行。 就在此時，被稱為『佐羅亞庫』的神奇寶貝竟然化身成為雷公、炎帝、水君的模樣，在王冠市的街道上大搞破壞。

　　就連相隔了20年再度回到這座城市的雪拉比，也面臨了危險……王冠市到底面臨著什么樣的危機？幻影的霸者『佐羅亞庫』的身份究竟是？雪拉比的命哂謺�如何？小智和皮卡丘是否能夠解救城里遭遇危險的神奇寶貝們？