高中一年級時的冬天，六合鴇時參觀了利用最先進技術在次世代博物館舉辦的大江戶幕府末巡迴展。在那裡有體驗幕府末的主題公園，利用CG混合技術並戴上特殊的目鏡即可。
然而在散步途中，鴇時被突然出現的妖怪鵺襲擊，從而進入到一個與江戶幕末時代相似，人與妖怪共存的名為“天月”的異世界中。
從鵺手中救出了鴇時的少女朽葉，一起參觀了幕府末巡迴展而來到天月的篠野女紺，儘管是同級生卻要大2歲，鴇時與他們一起探索著回到本來世界的方法。
在這之中，鴇時遇到了站在人類一邊的巫女銀硃和站在妖怪一邊的梵天，並開始逐漸了解到自己的使命。
為了回到原來世界“彼岸”成為“天月”的破壞者，抑或是為了守護“天月”而成為其支配者。鴇時將會採取的行動是.......